Tengo entre manos un proyecto de domótica que combina un par de Arduino Nano y una Raspberry Pi. Durante el desarrollo todo funcionó perfectamente, usé el IDE de arduino 5.0.1. Todo funcionaba perfectamente hasta que trasladé el desarrollo a la Raspberry Pi. En la RPi uso Arduino-Makefile, que permite de una forma muy sencilla compilar y cargar los programas a Arduino. Al compilar los sketches que vienen de ejemplo compiló y cargó todo, perfecto. »